Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim68Q8K243 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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