Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1eQ8K202 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr1eQ8K202 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms