Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1C9

Lrrc41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc41Q8K1C9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc41Q8K1C9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc41Q8K1C9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms