Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q4Q8HWB2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q4Q8HWB2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q4Q8HWB2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms