Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SbsnQ8CIT9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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SbsnQ8CIT9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SbsnQ8CIT9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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SbsnQ8CIT9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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SbsnQ8CIT9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms