Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Syne4Q8CII8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms