Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CopaQ8CIE6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CopaQ8CIE6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms