Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nupl2Q8CIC2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nupl2Q8CIC2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms