Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NgefQ8CHT1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NgefQ8CHT1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms