Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG48

Smc2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc2Q8CG48 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc2Q8CG48 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc2Q8CG48 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc2Q8CG48 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms