Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp11Q8CFF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp11Q8CFF0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp11Q8CFF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp11Q8CFF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp11Q8CFF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms