Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms