Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nup88Q8CEC0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms