Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc73Q8CDM4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms