Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ufl1Q8CCJ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms