Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf31Q8CCF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms