Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps53Q8CCB4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms