Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrip1Q8CBD1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms