Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phtf2Q8CB19 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms