Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg4aQ8C9S8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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