Protein–RNA interactions for Protein: Q8C804

Spice1, Spindle and centriole-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spice1Q8C804 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spice1Q8C804 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spice1Q8C804 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spice1Q8C804 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms