Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C708 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C708 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C708 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C708 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C708 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C708 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C708 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C708 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C708 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C708 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C708 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C708 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C708 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C708 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C708 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C708 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C708 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C708 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C708 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C708 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C708 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C708 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C708 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C708 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C708 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C708 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C708 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C708 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C708 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C708 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C708 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8C708 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8C708 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C708 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms