Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms