Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc90bQ8C3X2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc90bQ8C3X2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms