Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l1Q8C0J2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l1Q8C0J2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms