Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
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Usp47Q8BY87 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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Usp47Q8BY87 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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Usp47Q8BY87 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
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Usp47Q8BY87 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp47Q8BY87 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
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Usp47Q8BY87 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp47Q8BY87 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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