Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arfrp1Q8BXL7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfrp1Q8BXL7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfrp1Q8BXL7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms