Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr9Q8BV84 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr9Q8BV84 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms