Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdhaf4Q8BTE0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sdhaf4Q8BTE0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms