Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtripQ8BMG1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtripQ8BMG1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms