Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem260Q8BMD6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem260Q8BMD6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms