Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp54Q8BL06 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp54Q8BL06 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms