Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6bQ8BKI2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms