Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH02

Tor4a, Torsin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor4aQ8BH02 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tor4aQ8BH02 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tor4aQ8BH02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tor4aQ8BH02 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor4aQ8BH02 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor4aQ8BH02 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor4aQ8BH02 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor4aQ8BH02 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor4aQ8BH02 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tor4aQ8BH02 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms