Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnpo1Q8BFY9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnpo1Q8BFY9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms