Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4cQ811C2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4cQ811C2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms