Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TnnQ80Z71 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TnnQ80Z71 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TnnQ80Z71 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TnnQ80Z71 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TnnQ80Z71 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TnnQ80Z71 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms