Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stkld1Q80YS9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stkld1Q80YS9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stkld1Q80YS9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms