Protein–RNA interactions for Protein: Q80WG5

Lrrc8a, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8aQ80WG5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc8aQ80WG5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8aQ80WG5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8aQ80WG5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms