Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ell3Q80VR2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ell3Q80VR2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms