Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpp38Q80UU2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpp38Q80UU2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpp38Q80UU2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms