Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC43.27■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
NischQ80TM9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
NischQ80TM9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC43.13■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
NischQ80TM9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.49
NischQ80TM9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
NischQ80TM9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
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