Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lca5Q80ST9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms