Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdc42bpbQ7TT50 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms