Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ClmQ7TSN2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ClmQ7TSN2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClmQ7TSN2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms