Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Znf516Q7TSH3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf516Q7TSH3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf516Q7TSH3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms