Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mycbp2Q7TPH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mycbp2Q7TPH6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms