Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf250Q7TNU6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf250Q7TNU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf250Q7TNU6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms