Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno2Q7TNB8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbno2Q7TNB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno2Q7TNB8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms