Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Smap2Q7TN29 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smap2Q7TN29 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smap2Q7TN29 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms